Predicting fadeout versus persistence of paratuberculosis in a dairy cattle herd for management and control purposes: a modelling study

Epidemiological models enable to better understand the dynamics of infectious diseases and to assess ex-ante control strategies. For Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (Map), possible transmission routes have been described, but Map spread in a herd and the relative importance of the routes are currently insufficiently understood to prioritize control measures. We aim to predict early after Map introduction in a dairy cattle herd whether infection is likely to fade out or persist, when no control measures are implemented, using a modelling approach. Both vertical transmission and horizontal transmission via the ingestion of colostrum, milk, or faeces present in the contaminated environment were modelled. Calf-to-calf indirect transmission was possible. Six health states were represented: susceptible, transiently infectious, latently infected, subclinically infected, clinically affected, and resistant. The model was partially validated by comparing the simulated prevalence with field data. Housing facilities and contacts between animals were specifically considered for calves and heifers. After the introduction of one infected animal in a naive herd, fadeout occurred in 66% of the runs. When Map persisted, the prevalence of infected animals increased to 88% in 25 years. The two main transmission routes were via the farm's environment and in utero transmission. Calf-to-calf transmission was minor. Fadeout versus Map persistence could be differentiated with the number of clinically affected animals, which was rarely above one when fadeout occurred. Therefore, early detection of affected animals is crucial in preventing Map persistence in dairy herds

Rapid identification and quantification of Campylobacter coli and Campylobacter jejuni by real-time PCR in pure cultures and in complex samples

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p><it>Campylobacter </it>spp., especially <it>Campylobacter jejuni </it>(<it>C. jejuni</it>) and <it>Campylobacter coli </it>(<it>C. coli</it>), are recognized as the leading human foodborne pathogens in developed countries. Livestock animals carrying <it>Campylobacter </it>pose an important risk for human contamination. Pigs are known to be frequently colonized with <it>Campylobacter</it>, especially <it>C. coli</it>, and to excrete high numbers of this pathogen in their faeces. Molecular tools, notably real-time PCR, provide an effective, rapid, and sensitive alternative to culture-based methods for the detection of <it>C. coli </it>and <it>C. jejuni </it>in various substrates. In order to serve as a diagnostic tool supporting <it>Campylobacter </it>epidemiology, we developed a quantitative real-time PCR method for species-specific detection and quantification of <it>C. coli </it>and <it>C. jejuni </it>directly in faecal, feed, and environmental samples.</p> <p>Results</p> <p>With a sensitivity of 10 genome copies and a linear range of seven to eight orders of magnitude, the <it>C. coli </it>and <it>C. jejuni </it>real-time PCR assays allowed a precise quantification of purified DNA from <it>C. coli </it>and <it>C. jejuni</it>. The assays were highly specific and showed a 6-log-linear dynamic range of quantification with a quantitative detection limit of approximately 2.5 × 10²CFU/g of faeces, 1.3 × 10²CFU/g of feed, and 1.0 × 10³CFU/m²for the environmental samples. Compared to the results obtained by culture, both <it>C. coli </it>and <it>C. jejuni </it>real-time PCR assays exhibited a specificity of 96.2% with a kappa of 0.94 and 0.89 respectively. For faecal samples of experimentally infected pigs, the coefficients of correlation between the <it>C. coli </it>or <it>C. jejuni </it>real-time PCR assay and culture enumeration were R²= 0.90 and R²= 0.93 respectively.</p> <p>Conclusion</p> <p>The <it>C. coli </it>and <it>C. jejuni </it>real-time quantitative PCR assays developed in this study provide a method capable of directly detecting and quantifying <it>C. coli </it>and <it>C. jejuni </it>in faeces, feed, and environmental samples. These assays represent a new diagnostic tool for studying the epidemiology of <it>Campylobacter </it>by, for instance, investigating the carriage and excretion of <it>C. coli </it>and <it>C. jejuni </it>by pigs from conventional herds.</p

Seasonal and spatial heterogeneities in host and vector abundances impact the spatiotemporal spread of bluetongue

Bluetongue (BT) can cause severe livestock losses and large direct and indirect costs for farmers. To propose targeted control strategies as alternative to massive vaccination, there is a need to better understand how BT virus spread in space and time according to local characteristics of host and vector populations. Our objective was to assess, using a modelling approach, how spatiotemporal heterogeneities in abundance and distribution of hosts and vectors impact the occurrence and amplitude of local and regional BT epidemics. We built a reaction–diffusion model accounting for the seasonality in vector abundance and the active dispersal of vectors. Because of the scale chosen, and movement restrictions imposed during epidemics, host movements and wind-induced passive vector movements were neglected. Four levels of complexity were addressed using a theoretical approach, from a homogeneous to a heterogeneous environment in abundance and distribution of hosts and vectors. These scenarios were illustrated using data on abundance and distribution of hosts and vectors in a real geographical area. We have shown that local epidemics can occur earlier and be larger in scale far from the primary case rather than close to it. Moreover, spatial heterogeneities in hosts and vectors delay the epidemic peak and decrease the infection prevalence. The results obtained on a real area confirmed those obtained on a theoretical domain. Although developed to represent BTV spatiotemporal spread, our model can be used to study other vector-borne diseases of animals with a local to regional spread by vector diffusion

Pathogens identified in calves with neonatal gastro-enteritis in Vendée (France)

The object of this study was to describe the relative involvement of major pathogens in neonatal gastroenteritis in calves less than one month of age in Vendée (France). One to four samples of faeces from affected calves were collected in 127 farms serviced by 20 veterinary practices between 2002 and 2004. The study confirmed that several pathogens were involved in bovine neonatal gastroenteritis in Vendée. One of the four types of pathogenic E. coli tested for was isolated in over 65% of the samples, and CS31A was the most prevalent type. Cryptosporidia were also identified frequently, often in large quantities. Rotaviruses were found more frequently than Coronaviruses. No coccidian oocysts were found in animals less than one month of age.Cette étude avait pour objectif de décrire l'implication relative des agents pathogènes majeurs dans les gastro-entérites néonatales (GENN) du veau, en Vendée. L'étude a porté sur des veaux de moins d'un mois ayant une gastro-entérite néonatale. Des prélèvements de matières fécales (un à quatre) de veaux malades ont été recueillis dans 127 exploitations de vingt clientèles vétérinaires, durant la période 2002-2004. L'étude a confirmé l'origine multiple des GENN en Vendée. Plus de 65 % des prélèvements ont conduit à l'isolement d'un des 4 types pathogènes d'E. coli recherchés. Le sérotype CS31A était prédominant.Les cryptosporidies ont aussi été fréquemment mises en évidence, souvent en quantité importante. Les rotavirus ont été retrouvés plus fréquemment que les coronavirus. En dessous d'un mois d'âge, aucun ookyste de coccidies n'a été décelé

Managing Spoilers in a Hybrid War: The Democratic Republic of Congo (1996-2010)

Scholarship on the management of spoilers in a hybrid type of conflict is almost non-existent. Through an examination of the recent Congolese wars and peace efforts (1996–2010), we develop an understanding of how spoilers are managed in a conflict characterised by both interstate and intrastate dynamics. Certainly, more strategies of dealing with spoiler behaviours in this type of conflict are likely to emerge as similar cases are investigated, but our discussion recommends these non-related, but strongly interacting principles: the practice of inclusivity, usually preferred in the management of spoilers, is more complex, and in fact ineffective, particularly when concerned groups’ internal politics and supportive alliances are unconventional. Because holding elections is often deemed indispensable in peacemaking efforts, it is vital that total spoilers be prevented from winning or disrupting them. The toughest challenge is the protection of civilians, especially when the state lacks a monopoly on the use of violence and governance remains partitioned across the country

Diversité faunistique et bandes enherbées en zone de grandes cultures

Cette étude a pour but de développer les connaissances concernant la biodiversité ordinaire en grandes cultures. Elle a mis en évidence l intérêt de bandes enherbées pour restaurer une diversité faunistique, en particulier entomologique, et floristique. Les résultats issus de premières expérimentations sur les carabes, auxiliaires des cultures, ne permettent pas de conclure quant à l'influence des aménagements agro-écologiques sur leurs populations. Cependant les suivis de différents couverts montrent une interdépendance entre flore et faune et ont permis de dégager des préconisations de gestion.NANTES-Ecole Nat.Vétérinaire (441092302) / SudocTOULOUSE-EN Vétérinaire (315552301) / SudocSudocFranceF

Approche sanitaire descriptive du cheptel guadeloupéen par l'analyse des visites sanitaires de l'année 2006 et l'amélioration du système de déclaration sanitaire informatisée DéSI

Le manque d'organisation de la filière élevage en Guadeloupe implique indirectement des connaissances limitées sur les élevages et leur situation sanitaire. Deux systèmes de surveillance sanitaire peuvent être utilisés dans l'objectif de combler ces lacunes et dans le cadre du développement durable de la filière élevage en Guadeloupe : les visites sanitaires et le système de déclaration sanitaire informatisée DéSI. Les visites sanitaires ont été mises en place en 2005 avec un questionnaire adapté au contexte guadeloupéen. Les réponses fournies pour l'année 2006 représentent une base de 1735 élevages et de 145 variables. Le logiciel R a été utilisé pour analyser ces données, notamment en fonction de la taille et de la localisation des élevages. Les résultats obtenus précisent le risque sanitaire des exploitations guadeloupéennes et mettent en évidence une grande diversité des pratiques d'élevage sur le territoire guadeloupéen. Des modifications à apporter au questionnaire ont été proposées de manière à rendre les futures analyses encore plus pertinentes. Le réseau de surveillance sanitaire DéSI permettant d'identifier les maladies présentes sur le territoire et de surveiller l'émergence de nouvelles maladies nécessitait d'être relancé après sa diminution progressive d'activité. Une nouvelle version est née de la concertation des différents acteurs du réseau (vétérinaires sanitaires, DDSV, CIRAD) et constitue à présent un système de déclaration simplifié avec un concept d'animation et de rétro-informations amélioré. Les vétérinaires jouent ici le rôle de véritables sentinelles de terrain et l'objectif de ces modifications est de les inciter à s'investir dans le projet. Leur participation active s'impose en effet comme la clé de réussite du projet assurant la pérennité du réseau.NANTES-BU Médecine pharmacie (441092101) / SudocTOULOUSE-EN Vétérinaire (315552301) / SudocNANTES-Ecole Nat.Vétérinaire (441092302) / SudocSudocFranceF

Etat corporel et production laitière chez les vaches de race Prim'Holstein en début de lactation (identification de profils et relations avec les performances de reproduction)

Cette étude a été menée pendant deux ans sur 488 vaches réparties dans 10 élevages Prim'Holstein de la région Rhône-Alpes. L'objectif était d'identifier des profils de notes d'état corporel (NEC) et de " production laitière " caractérisant les primipares et les multipares et d'étudier leur influence sur les performances de reproduction. L'état corporel a été noté une fois par mois. La progestérone a été dosée dans le lait le jour de l'insémination (IA) et 21 jours plus tard. La gestation a été déterminée par échographie entre 35 et 45 jours après l'IA. Les paramètres laitiers (production laitière, TP, TB) ont été recueillis pendant les deux années d'étude. Quatre profils de NEC ont été identifiés : " bon état corporel ", " perte d'état élevée ", " reprise d'état rapide " et " état corporel insuffisant ". Les profils des multipares ont été en moyenne un demi point en dessous de ceux des primipares. Les 8 profils de " production laitière " identifiés sont apparus plus différents selon la parité du fait d'un niveau de production laitière plus élevé chez les multipares mais aussi de la survenue du pic de lactation beaucoup plus tardif chez les primipares. Les profils de NEC ont été liés aux délais d'apparition de la première chaleur et de mise à la reproduction uniquement chez les multipares. Les profils de " production laitière " ont également été liés au délai de mise à la reproduction chez les multipares. Seuls les profils de " production laitière " ont été associés à la fertilité.NANTES-Ecole Nat.Vétérinaire (441092302) / SudocSudocFranceF

Evaluation technico-économique d'un apport de graine de lin extrudée dans la ration de vaches laitières de quatre élevages des Pays de la Loire

La qualité de la matière grasse laitière préoccupe les industriels de l'agro-alimentaire car les consommateurs lui préfèrent de plus en plus les matières grasses d'origine végétale. Enrichir la matière grasse laitière en acides gras de type oméga 3 peut se faire en supplémentant l'alimentation des vaches avec de la graine de lin extrudée. Les effets zootechniques de cet aliment ont été observés durant huit mois dans quatre élevages laitiers. Une augmentation de la production laitière, une baisse du taux protéique et une baisse non significative du taux butyreux ont été notées. Les conséquences économiques de ce changement d'alimentation, tendent vers une augmentation de la recette laitière et des marges de culture végétale et une diminution des charges d'élevage, qui ne suffisent pas à compenser le surcoût alimentaire lié à l'emploi de la graine de lin extrudée. Trois des éleveurs ayant essayé cet aliment en sont satisfaits, au vu de l'état général et de la santé des animaux.NANTES-Ecole Nat.Vétérinaire (441092302) / SudocSudocFranceF

Valeur informative de la concentration en cellules somatiques du lait de quartier pour dépister l'infection intramammaire chez la vache laitière

RENNES1-BU Sciences Philo (352382102) / SudocPARIS-BIUP (751062107) / SudocSudocFranceF